RIP技術(shù)主要是運用針對目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來，經(jīng)過分離純化就可以對結(jié)合在復(fù)合物上的RNA進行q-PCR驗證或者測序分析。RIP是研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白結(jié)合情況的技術(shù)，是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動態(tài)過程的有力工具，可以幫助我們發(fā)現(xiàn)miRNA的調(diào)節(jié)靶點。根據(jù)需求，金開瑞可以提供RNA/蛋白、RNA/RNA互作驗證RIP技術(shù)服務(wù)。
 

　　應(yīng)用：
 

　　1.用抗體或表位標(biāo)記物捕獲細(xì)胞核內(nèi)或細(xì)胞質(zhì)中內(nèi)源性的RNA結(jié)合蛋白；
 

　　2.防止非特異性的RNA的結(jié)合；
 

　　3.免疫沉淀把RNA結(jié)合蛋白及其結(jié)合的RNA一起分離出來；
 

　　4.結(jié)合的RNA序列通過定量RT-PCR或高通量測序(RIP-Seq)方法來鑒定。
 

　　RIP實驗流程：
 

　　(一)細(xì)胞裂解液獲取
 

　　A.單層細(xì)胞或者貼壁細(xì)胞處理
 

　　1.冷PBS清洗培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶中的細(xì)胞兩次
 

　　2.加入冷PBS后用細(xì)胞刮將細(xì)胞刮下來，收集至enpendoff管
 

　　3.1500rpm，4℃離心5min，棄上清，收集細(xì)胞
 

　　4.用與細(xì)胞等體積的RIP裂解液重懸細(xì)胞，吹打均勻后于冰上靜置5min
 

　　5.每管分裝200ul細(xì)胞裂解液，貯存于-80℃
 

　　B.懸浮細(xì)胞處理：先收集細(xì)胞再計數(shù)，然后清洗裂解
 

　　C.組織樣品處理
 

　　1.冷PBS清洗新鮮切下的組織三次
 

　　2.加入冷PBS后，用勻漿器或其他細(xì)胞分離設(shè)備使組織分散為單個細(xì)胞，計數(shù)
 

　　3.1500rpm，4℃離心5min，棄上清，收集細(xì)胞
 

　　4.用與細(xì)胞等體積的RIP裂解液重懸細(xì)胞，吹打均勻后置于冰上靜置5min
 

　　5.每管分裝200ul細(xì)胞裂解液，貯存于-80℃
 

　　(二)磁珠的準(zhǔn)備
 

　　A.實驗前準(zhǔn)備
 

　　1、enpendoff管
 

　　2、磁力架
 

　　3、冰盒，RIPWashBuffer置于冰上
 

　　4、抗體，置于冰上
 

　　5、渦旋震蕩器
 

　　6、槍、槍頭放于超凈臺照射30min，槍噴DEPC水
 

　　B.磁珠準(zhǔn)備過程
 

　　1.重懸磁珠
 

　　2.標(biāo)記實驗所需的enpendoff管，樣品包括目的樣品，陰性對照與陽性對照
 

　　3.吸取50ul重懸后的磁珠懸液于每個enpendoff管
 

　　4.每管加入500ulRIPWashBuffer，渦旋震蕩
 

　　5.將enpendoff管置于磁力架上，并左右轉(zhuǎn)動15°使磁珠吸附成一條直線，去上清，重復(fù)一次
 

　　6.用100ul的RIPWashBuffer重懸磁珠，加入約5ug相應(yīng)抗體于每個樣品中
 

　　7.室溫孵育30min
 

　　8.將enpendoff管置于磁力架上，棄上清
 

　　9.加入500ulRIPWashBuffer，渦旋震蕩后棄上清，重復(fù)一次
 

　　10.加入500ulRIPWashBuffer，渦旋震蕩后置于冰上